До второй половины 1980-х гг. поддерживался высокий уровень боевой подготовки. Соединение по праву считалось одним из лучших в Военно-Морском флоте СССР. Ежегодно до 24 подводных лодок выполняли задачи боевой службы в различных районах Мирового океана.
За историю существования 4-й эскадры подводными лодками было совершено более 480 боевых служб в акватории Северного Ледовитого, Атлантического, Индийского и Тихого океанов, освоено 14 проектов дизельных подводных лодок.
В 1991 г. был совершен последний поход на боевую службу в Средиземное море. С 1992 г. подводные лодки соединения выполняли задачи боевой службы в Баренцевом и Норвежском морях.
1 августа 1995 г. 4-я эскадра подводных лодок переформирована в 40-ю дивизию подводных лодок Кольской флотилии разнородных сил Северного флота.